История рассказывает о Дзогоро Кобато, мальчике с отличными навыками дедукции, и Юки Осанаи, девушке с острым восприятием и сильной инициативой. Оба жаждут обычной жизни, первый из-за горького опыта, вторая из-за прошлых неудач. Однако по какой-то причине в их школьную жизнь один за другим врываются загадочные происшествия и несчастья.